De acuerdo a lo establecido en su normativa, la Asociación Uruguaya de Músicos cuenta con varias comisiones de trabajo, las cuales están integradas por socios directivos y por socios no directivos.
Comisiones permanentes:
Comisión de Relacionamiento con el Interior
Comisión de Cultura
Comisión de Prensa y Relaciones Públicas
Comisiones particulares:
Comisión de Reforma del Reglamento
Comisión de estudio y análisis del proyecto de Ley de contenidos nacionales para radio, televisión y cine